77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4086 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4086  Maleate cis-trans isomerase-like protein  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1912  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.81 
 
 		 247 aa  241  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1751  Asp/Glu racemase  48.39 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4754  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.36 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  48.16 
 
 		 249 aa  207  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  35.06 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.12 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.82 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.62 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.17 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.24 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.41 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  27.93 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  29.17 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  29.89 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.07 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.4 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.74 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  30.54 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  26.86 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  27.66 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  27.66 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  27.33 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.66 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  28.72 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.81 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  29.11 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  29.01 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  27.68 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0214  putative cis-trans isomerase  26.44 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.88 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  26.04 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3887  hypothetical protein  27.38 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  25.15 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1830  Asp/Glu racemase  29.11 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  26.67 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.99 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3786  Asp/Glu racemase  25.86 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  27.23 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.21 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2601  maleate cis-trans isomerase-like protein  25 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.21 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0068  putative isomerase  28.33 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0925133  hitchhiker  0.00725585 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3696  ectoine utilization protein EutA  24.55 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2514  Asp/Glu racemase  25.29 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.394743  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7135  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.29 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.997188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  25.6 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1296  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.01 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  0.0817455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  25.32 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2309  Asp/Glu racemase  25.7 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.723097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3928  Asp/Glu racemase  24.71 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45852  decreased coverage  0.00590655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1881  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.71 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.650539  normal  0.394704 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.2 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2711  Asp/Glu racemase  28.3 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1552  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.71 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00579321  normal  0.227664 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6044  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.26 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1852  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.14 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6543  hypothetical protein  23.63 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0302  Asp/Glu/hydantoin racemase  25 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3050  Asp/Glu racemase  28.08 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  28.48 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  26.45 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0733  putative Asp/Glu racemase  26.59 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.894763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0631  Asp/Glu racemase  24.19 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0652  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.86 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1822  maleate cis-trans isomerase protein  23.56 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.119562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1246  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.22 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4548  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.56 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383946  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3577  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.99 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1250  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.09 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3942  maleate cis-trans isomerase  22.99 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783757  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4618  Asp/Glu racemase  24.84 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1895  Asp/Glu racemase  22.99 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.929718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2142  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.41 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2119  Asp/Glu racemase  29.7 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296834  normal  0.0170584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  22.99 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  31.33 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>