78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1912 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1912  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  69.66 
 
 		 249 aa  331  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4086  Maleate cis-trans isomerase-like protein  51.81 
 
 		 252 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4754  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.52 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1751  Asp/Glu racemase  49.17 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.61 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  38.85 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.33 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.73 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.44 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.84 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.95 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.41 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  28.65 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.7 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  28.7 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  28.69 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  29.44 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  27.66 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  28.27 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.91 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3696  ectoine utilization protein EutA  26.29 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  27.38 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1830  Asp/Glu racemase  31.84 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  28.18 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  30.77 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3174  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  27.78 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  27.37 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  27.33 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  27.33 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.33 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  27.49 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  28.81 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.88 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1552  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.82 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00579321  normal  0.227664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4548  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.44 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383946  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1881  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.82 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.650539  normal  0.394704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1250  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.12 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1822  maleate cis-trans isomerase protein  27.37 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.119562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2514  Asp/Glu racemase  27.44 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.394743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3786  Asp/Glu racemase  26.22 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.88 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2309  Asp/Glu racemase  27.61 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.723097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2711  Asp/Glu racemase  29.11 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000640  asp/Glu racemase  25.93 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0501  IgiC, putative  27.72 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3928  Asp/Glu racemase  27.37 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45852  decreased coverage  0.00590655 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0214  putative cis-trans isomerase  25.14 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1296  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.82 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  0.0817455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  26.26 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6044  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.46 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4325  Asp/Glu racemase  25.61 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4041  Asp/Glu racemase  25.61 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3484  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.61 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.883286  hitchhiker  0.00122572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1246  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.57 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1852  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.95 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  25.61 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0652  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.58 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3050  Asp/Glu racemase  28.28 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.85 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.85 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  24.71 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  27.27 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2119  Asp/Glu racemase  27.93 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296834  normal  0.0170584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0831  Asp/Glu racemase  24.55 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4618  Asp/Glu racemase  26.88 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  25.64 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6543  hypothetical protein  28.19 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0733  putative Asp/Glu racemase  25.82 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.894763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3099  Asp/Glu racemase  24.06 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  27.34 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  20.81 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0068  putative isomerase  24.58 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0925133  hitchhiker  0.00725585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  22.35 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3781  Asp/Glu racemase  22.75 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5483  Asp/Glu racemase  23.39 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>