87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4205 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1822  maleate cis-trans isomerase protein  88.89 
 
 
252 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.119562  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0652  Asp/Glu/hydantoin racemase  86.11 
 
 
253 aa  447  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1296  Asp/Glu/hydantoin racemase  85.71 
 
 
252 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  0.0817455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1385  Asp/Glu racemase  73.79 
 
 
264 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2119  Asp/Glu racemase  74.09 
 
 
261 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296834  normal  0.0170584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2514  Asp/Glu racemase  69.76 
 
 
250 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.394743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3786  Asp/Glu racemase  69.76 
 
 
250 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0831  Asp/Glu racemase  71.85 
 
 
251 aa  357  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59669  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2309  Asp/Glu racemase  69.76 
 
 
250 aa  355  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.723097  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4041  Asp/Glu racemase  68.55 
 
 
250 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733285  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3484  Asp/Glu/hydantoin racemase  68.55 
 
 
250 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.883286  hitchhiker  0.00122572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4548  Asp/Glu/hydantoin racemase  68.55 
 
 
250 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383946  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4325  Asp/Glu racemase  68.55 
 
 
250 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1852  Asp/Glu/hydantoin racemase  68.27 
 
 
262 aa  351  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0214  putative cis-trans isomerase  70.73 
 
 
251 aa  349  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018775  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3928  Asp/Glu racemase  68.67 
 
 
279 aa  349  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45852  decreased coverage  0.00590655 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6044  Asp/Glu/hydantoin racemase  67.74 
 
 
250 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368354  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3577  Asp/Glu/hydantoin racemase  66.94 
 
 
250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3942  maleate cis-trans isomerase  67.48 
 
 
250 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783757  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1895  Asp/Glu racemase  67.48 
 
 
250 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.929718  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2142  Asp/Glu/hydantoin racemase  66.13 
 
 
250 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3672  maleate cis-trans isomerase  66.12 
 
 
254 aa  332  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1552  Asp/Glu/hydantoin racemase  64.66 
 
 
250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00579321  normal  0.227664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1881  Asp/Glu/hydantoin racemase  64.26 
 
 
250 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.650539  normal  0.394704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3099  Asp/Glu racemase  63.05 
 
 
253 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5483  Asp/Glu racemase  62.86 
 
 
252 aa  315  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4901  Asp/Glu racemase  60.32 
 
 
260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1250  Asp/Glu/hydantoin racemase  55.69 
 
 
282 aa  270  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3781  Asp/Glu racemase  53.66 
 
 
252 aa  261  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  32.52 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.57 
 
 
242 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.92 
 
 
262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  26.45 
 
 
251 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.18 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  34.78 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  34.39 
 
 
271 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  35.81 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  25 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  28.69 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  28.4 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  27.09 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.6 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  27.02 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  30.46 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3174  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.62 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  27.02 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  26.36 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3696  ectoine utilization protein EutA  28.34 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  27.03 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0631  Asp/Glu racemase  26.8 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579277  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0302  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.5 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  24.42 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0733  putative Asp/Glu racemase  26.8 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.894763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  24.51 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.41 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.58 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.1 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.5 
 
 
268 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.73 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1830  Asp/Glu racemase  25.42 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7135  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.32 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.997188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.21 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  25.81 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.3 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3050  Asp/Glu racemase  29.28 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  25.2 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  27.27 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.27 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  27.05 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1912  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.26 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.51 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.51 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  30.89 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6543  hypothetical protein  24.59 
 
 
242 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0462  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.72 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680828  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3887  hypothetical protein  22.18 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0068  putative isomerase  25.41 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0925133  hitchhiker  0.00725585 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  23.14 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  22.58 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  23.2 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3716  IgiC, putative  22.87 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1246  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.19 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.98 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0501  IgiC, putative  27.64 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4754  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.27 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1751  Asp/Glu racemase  21.26 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>