67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4754 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4754  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1912  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.52 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  53.62 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1751  Asp/Glu racemase  50.41 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4086  Maleate cis-trans isomerase-like protein  49.36 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.48 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.18 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  36.75 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.06 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.33 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.26 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  30.11 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.65 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.45 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.52 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.92 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  27.61 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1830  Asp/Glu racemase  29.83 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.72 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.72 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  25.29 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3887  hypothetical protein  28.24 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  27.32 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0631  Asp/Glu racemase  27.54 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  27.44 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  23.6 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  27.49 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  25 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  26.15 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  28.95 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.86 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  24.86 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2711  Asp/Glu racemase  29.89 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3174  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  23.57 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000640  asp/Glu racemase  24.07 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  24.73 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.87 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6543  hypothetical protein  23.5 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  21.88 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7135  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.27 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.997188 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.08 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  25.64 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  24.37 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.73 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4548  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.22 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383946  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3696  ectoine utilization protein EutA  22.36 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4325  Asp/Glu racemase  27.22 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3484  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.22 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.883286  hitchhiker  0.00122572 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4041  Asp/Glu racemase  27.22 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5483  Asp/Glu racemase  30.6 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3050  Asp/Glu racemase  28.49 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0068  putative isomerase  21.12 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0925133  hitchhiker  0.00725585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3781  Asp/Glu racemase  26.09 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0214  putative cis-trans isomerase  26.16 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3786  Asp/Glu racemase  25.44 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6044  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.28 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  28.76 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  23.53 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  28.76 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  28.76 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3099  Asp/Glu racemase  26.67 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2514  Asp/Glu racemase  25.44 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.394743  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.76 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2309  Asp/Glu racemase  27.98 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.723097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0831  Asp/Glu racemase  23.81 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  25.27 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0733  putative Asp/Glu racemase  24.18 
 
 		 241 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.894763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>