56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000640 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000640  asp/Glu racemase  100 
 
 		 258 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.04 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  36.57 
 
 		 276 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  36.07 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  37.39 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  37.39 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.97 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.62 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  36.87 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  36.87 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1830  Asp/Glu racemase  33.8 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  32.22 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  31.09 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2711  Asp/Glu racemase  31.56 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.88 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  32.42 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3696  ectoine utilization protein EutA  32 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  31.56 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3174  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.56 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  28.51 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.09 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0068  putative isomerase  33.77 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0925133  hitchhiker  0.00725585 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.55 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  27.11 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  28.63 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.02 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.26 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.32 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.38 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  27.78 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  23.46 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1912  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.93 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  28.93 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0733  putative Asp/Glu racemase  25.42 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.894763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4754  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.07 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3050  Asp/Glu racemase  27.34 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3132  Asp/Glu racemase  24.45 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.36 
 
 		 259 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  26.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.41 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6543  hypothetical protein  24.88 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4618  Asp/Glu racemase  27.43 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  26.38 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0462  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.73 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680828  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.31 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.31 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1246  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.2 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3887  hypothetical protein  26.71 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0631  Asp/Glu racemase  25.93 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7135  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.86 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.997188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.08 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  22.84 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  25 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1751  Asp/Glu racemase  25.89 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  28.81 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  25 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>