54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3132 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3132  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.56 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  35.59 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3716  IgiC, putative  34.57 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  31.93 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0501  IgiC, putative  30.74 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2601  maleate cis-trans isomerase-like protein  28.3 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.27 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.27 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  27.11 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  25.45 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0631  Asp/Glu racemase  26.23 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.45 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.31 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0462  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.46 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680828  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  27.03 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  20.85 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  21.85 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  30.65 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  25.79 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.37 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.27 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.55 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.02 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.65 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  27.62 
 
 		 271 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3887  hypothetical protein  27.69 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000640  asp/Glu racemase  24.45 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  26.38 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7135  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.09 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.997188 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  27.2 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4618  Asp/Glu racemase  25.33 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1830  Asp/Glu racemase  25.97 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.54 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  26.67 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.2 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.23 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.23 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  20.25 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  21.05 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.22 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  25.44 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  31.15 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0652  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.97 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0733  putative Asp/Glu racemase  24.78 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.894763 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  26.19 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  25.52 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3174  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.05 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2711  Asp/Glu racemase  29.09 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3781  Asp/Glu racemase  22.41 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  22.5 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  22.7 
 
 		 263 aa  42  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  22.58 
 
 		 259 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  24.18 
 
 		 249 aa  42  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>