35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3716 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3716  IgiC, putative  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.73 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  40.32 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0501  IgiC, putative  41.43 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  35.22 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3132  Asp/Glu racemase  34.57 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2601  maleate cis-trans isomerase-like protein  32.59 
 
 		 285 aa  118  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  27.31 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.49 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.51 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4991  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.71 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.9 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.62 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  26.8 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1822  maleate cis-trans isomerase protein  24.33 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.119562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  23.73 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  24 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3887  hypothetical protein  26.72 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  23.77 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  26.32 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7935  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.61 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770582  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  30.51 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  26.29 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  29.91 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.66 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  29.66 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  29.66 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.91 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.91 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  22.87 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1296  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.75 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  0.0817455 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0733  putative Asp/Glu racemase  24.08 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.894763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1250  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.69 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  22.04 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4618  Asp/Glu racemase  26.8 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>