54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0501 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0501  IgiC, putative  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3716  IgiC, putative  41.43 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  38 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  40.08 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  34.57 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2601  maleate cis-trans isomerase-like protein  32.74 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3132  Asp/Glu racemase  30.74 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.84 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1912  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.72 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.32 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1822  maleate cis-trans isomerase protein  26.82 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.119562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3786  Asp/Glu racemase  29.84 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2514  Asp/Glu racemase  29.84 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.394743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0652  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.05 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.1 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6044  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.64 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  31.69 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0214  putative cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  26.95 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  27.64 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  26.23 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  27.53 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  29.89 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  31.36 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4041  Asp/Glu racemase  28.34 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1250  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.94 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4325  Asp/Glu racemase  28.34 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3484  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.34 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.883286  hitchhiker  0.00122572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  25.24 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4548  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.53 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383946  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  26.19 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  25.71 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1296  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.61 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  0.0817455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  25.71 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.71 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.4 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.24 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4278  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.81 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.33 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  25.85 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3577  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.02 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3942  maleate cis-trans isomerase  28.02 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783757  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1895  Asp/Glu racemase  28.02 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.929718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  24.75 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  26.42 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  25.23 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.93 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1751  Asp/Glu racemase  25.13 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2142  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.67 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0046  Asp/Glu racemase  27.97 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3928  Asp/Glu racemase  26.61 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45852  decreased coverage  0.00590655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2309  Asp/Glu racemase  26.25 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.723097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.47 
 
 		 249 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3781  Asp/Glu racemase  25 
 
 		 252 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>