45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1751 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1751  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1912  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.17 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4086  Maleate cis-trans isomerase-like protein  48.39 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4754  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.41 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  48.55 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  34.97 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.99 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.95 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.11 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.56 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  29.05 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  28.14 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.98 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  27.66 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.95 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  27.65 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  26.78 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1830  Asp/Glu racemase  31.49 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3174  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.33 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0068  putative isomerase  26.09 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0925133  hitchhiker  0.00725585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.21 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  23.81 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  25.93 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  26.36 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  25.81 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  23.37 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  26.51 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.89 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  25.73 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  27.98 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  23.33 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  25.94 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.37 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.94 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3696  ectoine utilization protein EutA  26.52 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.08 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3887  hypothetical protein  24.26 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1246  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.27 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000640  asp/Glu racemase  25.89 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  27.65 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2711  Asp/Glu racemase  28.57 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3781  Asp/Glu racemase  30.39 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4021  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.29 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4134  Asp/Glu/hydantoin racemase  21.29 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  21.26 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>