70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4096 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4096  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1750  Asp/Glu racemase  58.49 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4753  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.32 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1911  Asp/Glu/hydantoin racemase  47.69 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1912  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0732  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.74 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3570  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.92 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30140  maleate cis-trans isomerase  36.72 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1394  Asp/Glu racemase  30.43 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1830  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7794  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.94 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4754  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.26 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04928  arylmalonate decarboxylase  29.44 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2711  Asp/Glu racemase  32 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3580  Asp/Glu racemase  29.13 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0282607  normal  0.268208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000640  asp/Glu racemase  32.02 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4086  Maleate cis-trans isomerase-like protein  35.62 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0887  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.95 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7410  arylmalonate decarboxylase  30.4 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4918  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.82 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1751  Asp/Glu racemase  30.98 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5239  ectoine utilization protein EutA  34.67 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.801874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1639  Asp/Glu racemase  25.11 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.822276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5518  ectoine utilization protein EutA  32.26 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4999  Asp/Glu racemase  26.58 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155445  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3395  Asp/Glu racemase  33.12 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1038  Asp/Glu racemase  30.81 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.800252  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6640  Asp/Glu racemase  32.47 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0068  putative isomerase  35.14 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0925133  hitchhiker  0.00725585 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6238  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.47 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6407  Asp/Glu racemase  32.47 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4472  Asp/Glu racemase  26.69 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3696  ectoine utilization protein EutA  32.5 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0284  Asp/Glu racemase  31.03 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1310  Arylmalonate decarboxylase  29.38 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2142  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.4 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4067  Asp/Glu racemase  28.7 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3942  maleate cis-trans isomerase  27.78 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783757  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3577  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.78 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1895  Asp/Glu racemase  27.78 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.929718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6615  Asp/Glu racemase  28 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4076  Asp/Glu racemase  35.29 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.722291  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6044  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.95 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0109  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.29 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3928  Asp/Glu racemase  29.23 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45852  decreased coverage  0.00590655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1852  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.46 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3174  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.05 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3786  Asp/Glu racemase  27.16 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2514  Asp/Glu racemase  27.78 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.394743  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0214  putative cis-trans isomerase  30.34 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.018775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3050  Asp/Glu racemase  30.87 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2031  Asp/Glu racemase  29.2 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329211  normal  0.0464221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3132  Asp/Glu racemase  31.54 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4548  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.95 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383946  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4041  Asp/Glu racemase  27.95 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3484  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.95 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.883286  hitchhiker  0.00122572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4325  Asp/Glu racemase  27.95 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3972  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.14 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0631  Asp/Glu racemase  26.2 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0302  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.03 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4618  Asp/Glu racemase  28.21 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2309  Asp/Glu racemase  25.77 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.723097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0550  Asp/Glu racemase  32.8 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1250  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.45 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1296  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.95 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  0.0817455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2119  Asp/Glu racemase  28.57 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296834  normal  0.0170584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0462  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.77 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680828  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0652  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.81 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4205  Asp/Glu racemase  27.98 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1822  maleate cis-trans isomerase protein  27.38 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.119562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>