86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0756 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0756  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
368 aa  760    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  29.11 
 
 
368 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
368 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
95 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 
89 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
95 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
95 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
95 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 
102 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
91 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 
95 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  30.12 
 
 
107 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  30.12 
 
 
107 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  29.76 
 
 
117 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  27.59 
 
 
113 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
221 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
90 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 
103 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 
218 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 
104 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1099  ArsR family transcriptional regulator  21.58 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
216 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
90 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  23.48 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
94 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
96 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
85 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
103 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
107 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
123 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 
114 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
98 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
127 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  29.47 
 
 
98 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  28.92 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
223 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  30.53 
 
 
98 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1004  ArsR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000308504  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  29.27 
 
 
118 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  27.38 
 
 
221 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  30.53 
 
 
98 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 
218 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  19.28 
 
 
245 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0706  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
139 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  26.32 
 
 
114 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
106 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  25.23 
 
 
120 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 
125 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
222 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
92 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0540  regulatory protein ArsR  27.4 
 
 
227 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 
89 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  25.77 
 
 
127 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
437 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
121 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  29.47 
 
 
98 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
111 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  34.43 
 
 
94 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2855  ArsR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
265 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 
90 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 
125 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
110 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
196 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0386  ArsR family transcriptional regulator  23.75 
 
 
230 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 
114 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  23.64 
 
 
126 aa  42.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
127 aa  42.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
114 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
221 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  30.59 
 
 
114 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>