More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0641 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0117  aminotransferase  77.42 
 
 		 434 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3325  aminotransferase  75.81 
 
 		 434 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0730  aminotransferase  81.11 
 
 		 434 aa  744    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0627  aminotransferase  98.85 
 
 		 434 aa  887    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0641  aminotransferase  100 
 
 		 434 aa  895    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2774300000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3249  aminotransferase  70.05 
 
 		 434 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0622  aminotransferase  71.89 
 
 		 434 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0011  aminotransferase  64.06 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3570  aminotransferase  62.21 
 
 		 451 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0984  aminotransferase  54.84 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0542208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1384  aminotransferase  54.61 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0182  aminotransferase  53.69 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0641  aminotransferase  53.69 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.795024  hitchhiker  0.00403195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1277  aminotransferase  53.23 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0402173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0707  aminotransferase  53.92 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0991  aminotransferase  53.92 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  27.41 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  27.91 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  28.57 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  28.35 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  27.08 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  27.72 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  27.11 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  27.11 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  29.02 
 
 		 505 aa  140  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  27.59 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27.41 
 
 		 404 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  27.43 
 
 		 409 aa  140  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  28.61 
 
 		 423 aa  139  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  27.11 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.25 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  27.69 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  28.11 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  27.11 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  26.87 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  28.11 
 
 		 508 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  29.12 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  25.06 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  26.48 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  27.11 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  27.16 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  27.11 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  27.11 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.11 
 
 		 546 aa  137  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  27.05 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.16 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  26.42 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  27.05 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  26.6 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  27.18 
 
 		 411 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  24.94 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  27.25 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  26.48 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  28.53 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  26.37 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  25.99 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  27.56 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  27.38 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  29.91 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  25.93 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  27.49 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  27.6 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  27.66 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  25.58 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  25.62 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.14 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.21 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  26.02 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  29.34 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.74 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  27.66 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  23.96 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  27.89 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  27.89 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  27.36 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  25.92 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  27.89 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  25.43 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  25.56 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  27.89 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  28.83 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  27.89 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  27.89 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  27.89 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  27.89 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  29.79 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  29.31 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  27.73 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  27.09 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  25.12 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  26.78 
 
 		 403 aa  126  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  28.24 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  28.53 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  27.03 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>