More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1384 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1384  aminotransferase  100 
 
 		 433 aa  897    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0011  aminotransferase  57.37 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0627  aminotransferase  54.84 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0641  aminotransferase  54.61 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2774300000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3325  aminotransferase  54.38 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3570  aminotransferase  54.21 
 
 		 451 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0117  aminotransferase  52.76 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0707  aminotransferase  52.78 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0730  aminotransferase  53.46 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0641  aminotransferase  51.5 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.795024  hitchhiker  0.00403195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1277  aminotransferase  51.5 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0402173  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0182  aminotransferase  51.27 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0984  aminotransferase  51.85 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0542208  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0991  aminotransferase  54.15 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3249  aminotransferase  52.07 
 
 		 434 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0622  aminotransferase  50.46 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  27.83 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  32.33 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  30.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  30.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  30.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  31.12 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  30.72 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  30.72 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  30.72 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  30.72 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  30.51 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  29.43 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  29.61 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  27.9 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  30.51 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  30.51 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  29.31 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  29.31 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  30.51 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  28.08 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  28.47 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  27.59 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  26.78 
 
 		 409 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  29.61 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  30.81 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  29.61 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  28.95 
 
 		 410 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  30.81 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  30.21 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  27.9 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  29.64 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.77 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  28.15 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  30.81 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  30.12 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  29.82 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  27.66 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  26.3 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.59 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  30.52 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  30.52 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  27.12 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  30.91 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  26.95 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  28.61 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  27.08 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  28.01 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  30.26 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  29.02 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  29.98 
 
 		 440 aa  136  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.88 
 
 		 543 aa  136  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  28.73 
 
 		 406 aa  136  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  26.89 
 
 		 546 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  27.23 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  26.42 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  29.31 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  30.3 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  30.26 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  27.74 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  27.42 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.94 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  29.31 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  27.02 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  29 
 
 		 505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  32.23 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  32.23 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  32.23 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>