More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0117 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0117  aminotransferase  100 
 
 		 434 aa  902    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0730  aminotransferase  82.49 
 
 		 434 aa  752    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0641  aminotransferase  77.42 
 
 		 434 aa  717    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2774300000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3325  aminotransferase  89.17 
 
 		 434 aa  819    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0627  aminotransferase  77.19 
 
 		 434 aa  717    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3249  aminotransferase  72.58 
 
 		 434 aa  673    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0622  aminotransferase  74.42 
 
 		 434 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0011  aminotransferase  64.98 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3570  aminotransferase  60.6 
 
 		 451 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0984  aminotransferase  53.46 
 
 		 433 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0542208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0182  aminotransferase  53.23 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0641  aminotransferase  53.23 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.795024  hitchhiker  0.00403195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1277  aminotransferase  52.76 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0402173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1384  aminotransferase  52.76 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0991  aminotransferase  52.76 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0707  aminotransferase  52.78 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  29.05 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  29.98 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.05 
 
 		 505 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  28.47 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  28.68 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  27.16 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  27.99 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  28.5 
 
 		 423 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  28 
 
 		 432 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  27.99 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  28.5 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  26.76 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  28.75 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  28.41 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  28.75 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  28.75 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  28.75 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  28.75 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  28.75 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  30.51 
 
 		 406 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  28.78 
 
 		 508 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  30.33 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  29.36 
 
 		 545 aa  140  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  27.12 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  27.25 
 
 		 404 aa  140  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  26.35 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  28.4 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.74 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  29.91 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  26.82 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  27.82 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.44 
 
 		 546 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  27.42 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  28.32 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  29.43 
 
 		 411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  26.35 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  25 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  30.51 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.16 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  27.56 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  27.14 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  25.35 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  28.35 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.93 
 
 		 534 aa  133  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  28.05 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  29.34 
 
 		 395 aa  133  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  25.91 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  25.91 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  25.91 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  25.91 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  26.29 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.49 
 
 		 518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  27.44 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  26.96 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  28.35 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  25.18 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  27.16 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.88 
 
 		 543 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  28.35 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  30.89 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  28.05 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  25.64 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  27.36 
 
 		 405 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  26.46 
 
 		 426 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  28.14 
 
 		 429 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  28.14 
 
 		 429 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  28.27 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  28.27 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  25.71 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  28.27 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  26.79 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  26.23 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  25.62 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  27.74 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  28.92 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>