More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0991 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0991  aminotransferase  100 
 
 		 434 aa  889    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0011  aminotransferase  55.76 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0641  aminotransferase  53.92 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2774300000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0627  aminotransferase  53.92 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3325  aminotransferase  53.46 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0117  aminotransferase  52.76 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0730  aminotransferase  52.07 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1384  aminotransferase  54.15 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3570  aminotransferase  51.84 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0622  aminotransferase  50.23 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3249  aminotransferase  51.15 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0984  aminotransferase  53 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0542208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0641  aminotransferase  53.46 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.795024  hitchhiker  0.00403195 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0707  aminotransferase  52.75 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1277  aminotransferase  53.23 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0402173  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0182  aminotransferase  53.23 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  28.67 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  26.72 
 
 		 409 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  31.63 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  33.33 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  32.99 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  32.86 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  32.99 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  33.81 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  32.64 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  32.03 
 
 		 426 aa  140  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  31.97 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  30.93 
 
 		 508 aa  138  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  32.74 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  28.36 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  31.21 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  31.21 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  27.21 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  26.44 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  28.97 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  31.21 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  29.25 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  27.45 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  29.03 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  26.78 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  28.1 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.36 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  31.25 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  26.94 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  28.84 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  27.8 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  25.12 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  27.38 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  28.1 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  28.57 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  29.53 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 404 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.66 
 
 		 543 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  27.63 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  30.95 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  27.96 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  27.66 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  28.57 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  27.25 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  34.4 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  27.96 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.39 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  30.9 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  28.27 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  27.14 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  30.9 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27.36 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  30.9 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  33.69 
 
 		 406 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  28.1 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  30.72 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  30.74 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  28.15 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  30.21 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  30.9 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  27.79 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  30.21 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  27.46 
 
 		 405 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>