More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3570 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3570  aminotransferase  100 
 
 		 451 aa  931    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0011  aminotransferase  67.05 
 
 		 434 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0641  aminotransferase  62.21 
 
 		 434 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2774300000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0730  aminotransferase  62.44 
 
 		 434 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0627  aminotransferase  62.21 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0117  aminotransferase  60.6 
 
 		 434 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3325  aminotransferase  60.14 
 
 		 434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0622  aminotransferase  58.06 
 
 		 434 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0984  aminotransferase  55.86 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0542208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3249  aminotransferase  55.53 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1277  aminotransferase  54.48 
 
 		 434 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0402173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0641  aminotransferase  54.48 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.795024  hitchhiker  0.00403195 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0182  aminotransferase  54.02 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0707  aminotransferase  53.79 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1384  aminotransferase  54.21 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0991  aminotransferase  51.84 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  31.4 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  33.23 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  31.49 
 
 		 505 aa  156  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  28.11 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  28.71 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  28.47 
 
 		 409 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  31.71 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  31.42 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  31.12 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  31.12 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  31.12 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  31.02 
 
 		 406 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  31.12 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  30 
 
 		 426 aa  149  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  28.23 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  28.95 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  30.82 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  29.09 
 
 		 545 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  30.92 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  31.09 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  27.79 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  28.37 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  29.91 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  28.33 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  29.94 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  30.91 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  30.06 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  28.88 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.48 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  28.88 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  30.06 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  28.88 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  28.88 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  28.88 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  31.96 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  30.21 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  28.34 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  30.21 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  28.88 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  29.91 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  28.88 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  28.34 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  28.88 
 
 		 404 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  27.54 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  29.76 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  31.91 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  29.61 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  27.52 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  29.46 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  29.22 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  29.31 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.51 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  26.76 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  28.92 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  28.54 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.03 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.57 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  30.12 
 
 		 426 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  26.15 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  31.42 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  29.7 
 
 		 404 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  28.31 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  29.91 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  27.46 
 
 		 410 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  28.18 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  26.67 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  26.77 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  28.66 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  28.23 
 
 		 412 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  29.31 
 
 		 404 aa  136  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.49 
 
 		 543 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  28.66 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  28.66 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>