174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0637 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0637  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 292 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0323721  normal  0.626877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1512  palmitoyl-CoA hydrolase  45.77 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000784091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  39.42 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  37.55 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  37.99 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  37.99 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  37.91 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  39.71 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  37.41 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  35.79 
 
 		 294 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  39.78 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  37.14 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  39.93 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  37.37 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  39.05 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  36.96 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  36.73 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  36.49 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  35.4 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  37.68 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  34.83 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  37.18 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  38.49 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  36.79 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  33.92 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  36.81 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  35.4 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  34.93 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  34.88 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  36.33 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  35.23 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  32.98 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  32.73 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  32.98 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  34.88 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  32.37 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  34.81 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  34.81 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  34.81 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  36.46 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  33.22 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  36.43 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  37.37 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2850  palmitoyl-CoA hydrolase  36.3 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  34.82 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  36.82 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  37.33 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  36.76 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  36.4 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  33.93 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  33.21 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  33.94 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  31.36 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  33.21 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  34.06 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  34.46 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  35.66 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  32 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  35.66 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  35.71 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  33.45 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  34.27 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  34.74 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  35.06 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  32.34 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  33.33 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  32.73 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  32.36 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  32.36 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  32.36 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  35.74 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  36.86 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1035  palmitoyl-CoA hydrolase  34.23 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  32 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  33.57 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  31.97 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  32.86 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2249  acyl-CoA thioesterase II  34.43 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2296  acyl-CoA thioesterase II  34.43 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2288  acyl-CoA thioesterase II  34.43 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  34.17 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  32.86 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  32.52 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  31.97 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  35.61 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  33.94 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  32.37 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  32.01 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  32.01 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2964  acyl-CoA thioesterase  35.44 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.86886 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>