34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3342 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  65.09 
 
 		 231 aa  284  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  48.11 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.79 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  42.31 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  40.38 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  36.53 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  41.35 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.68 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  41.04 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  39.44 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.76 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  44.13 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  41.59 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  40.51 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  40.09 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.59 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  40.38 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  38.28 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  35.22 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  40.58 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  40.36 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  35.5 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0238  CRISPR-associated Cas5d family protein  34.06 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  35.47 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  34.2 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  29.7 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.12 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  29.51 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  25.68 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.11 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  24.86 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  29.31 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  28.3 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>