28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2183 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  42.08 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  31.96 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.96 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.76 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  29.76 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.36 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  28.88 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  29.88 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  29.55 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  29.7 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  29.55 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.31 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  27.11 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  25.62 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.27 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.01 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  26.72 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.18 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  31.29 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  24.55 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  26.37 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.14 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.43 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.17 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  33.33 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  26.88 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>