34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1003 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  100 
 
 		 221 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  64.95 
 
 		 220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  62.21 
 
 		 224 aa  275  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  62.91 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  64.62 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  58.26 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  59.91 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  59.01 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  57.41 
 
 		 223 aa  251  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  58.82 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  60.5 
 
 		 204 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  58.29 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  53 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  55.77 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  52.8 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  52.45 
 
 		 221 aa  211  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  49.76 
 
 		 218 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  50 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  46.78 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  46.78 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  47.14 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0238  CRISPR-associated Cas5d family protein  38.56 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  36.99 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  38.17 
 
 		 248 aa  141  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  39.07 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  40.09 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.73 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  26.41 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.52 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.24 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  27.06 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  26.73 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  27.43 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  27.49 
 
 		 211 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>