28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3520 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  100 
 
 		 240 aa  504  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  69.4 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  62.07 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  61.34 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  60.58 
 
 		 238 aa  298  5e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  58.87 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.43 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.33 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  28.83 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  29.41 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.54 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  27.88 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.52 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  28.84 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.7 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.49 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  24.77 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  30.43 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  28.51 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.79 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  26.61 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  23.87 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  26.11 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  25.58 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  29.93 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.33 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  23.42 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>