29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3902 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  100 
 
 		 237 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  69.4 
 
 		 240 aa  341  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  60.43 
 
 		 233 aa  310  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  64.07 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  61.99 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  55.88 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.45 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  30.43 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.77 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  30.48 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.17 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.91 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  29.09 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.77 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  27.15 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.23 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  29.06 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.73 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.86 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  24.3 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  24.87 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  27.33 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  24.66 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  26.84 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  24.05 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  37.1 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  23.44 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  25.38 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  28.3 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>