34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1065 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  100 
 
 		 227 aa  474  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  55.7 
 
 		 222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  56.44 
 
 		 221 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  52.32 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  52.74 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  53.45 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  50.86 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  53.05 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  50.84 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  52.38 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  48.48 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  51.98 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  50 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  50 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  47.75 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  49.77 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  46.08 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  48.42 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  44.19 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  46.52 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.86 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  45.9 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0238  CRISPR-associated Cas5d family protein  34.63 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  44.13 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  35.74 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  35.2 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.05 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  24.55 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  29.14 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.22 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  27.33 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  26.17 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  26.62 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.93 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>