34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1296 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  100 
 
 		 237 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  83.97 
 
 		 237 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  56.61 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  54.69 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  51.5 
 
 		 218 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  52.32 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  48.96 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  46.67 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  46.31 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  46.03 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  48.09 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  46.78 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.09 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  45.56 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  44.63 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  44.74 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.67 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.67 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  45.69 
 
 		 218 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  42.98 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  42.67 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  37.66 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  36.3 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0238  CRISPR-associated Cas5d family protein  34.83 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  35.79 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  35.22 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  31.96 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  25.82 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  28.96 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  24.71 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  23.87 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  26.11 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  26.11 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  23.44 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>