34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1972 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  59.91 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  57.87 
 
 		 220 aa  255  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  60.18 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  55.07 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  59.82 
 
 		 227 aa  244  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  56.5 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  55.45 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  53.24 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  54.46 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  54.78 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  56.8 
 
 		 204 aa  214  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  51.16 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  50.88 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  54.81 
 
 		 218 aa  207  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  50.23 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  50.46 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  51.98 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  48.96 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  48.13 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  47.25 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0238  CRISPR-associated Cas5d family protein  43.1 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  42.62 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  41.56 
 
 		 248 aa  148  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  42.79 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  42.11 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  35.29 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  30 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  28.96 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  30.91 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  27.01 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.7 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  28.4 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>