30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1488 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  100 
 
 		 247 aa  511  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  86.18 
 
 		 248 aa  433  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0238  CRISPR-associated Cas5d family protein  63.56 
 
 		 251 aa  331  7.000000000000001e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  41.7 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  40.17 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.62 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  40 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  38.65 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  40.34 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.8 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.99 
 
 		 221 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  36.3 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  37.82 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  39.92 
 
 		 224 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  37.8 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  36.95 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  39.84 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.4 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.67 
 
 		 211 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.71 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  35.74 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.3 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.07 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  35.29 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  34.2 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  34.05 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  26.88 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  29.24 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  24.02 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  29.59 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>