29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3937 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  100 
 
 		 231 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0232  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  35.25 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1880  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  28.02 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1020  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  26.44 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3203  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  28.5 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2519  hypothetical protein  32.82 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0640  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  30.12 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0611844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1185  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  24.77 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0307  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  22.97 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0622  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  26.43 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0974  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.87 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2835  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  27.43 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1071  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  24.07 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29878  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1452  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  30.13 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0939  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.32 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0769  CRISPR-associated Cas5 family protein  23.85 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2324  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  24.79 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.470666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0268  CRISPR-associated Cas5h family protein  27.7 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0538  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  27.53 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1421  CRISPR-associated protein Cas5  22.07 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  38.33 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2662  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  25 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0352  CRISPR-associated Cas5 family protein  44.68 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00575907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  40 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  29.59 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  32.89 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3330  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  27.81 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2427  CRISPR-associated protein Cas5  24.39 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.474522  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  30.56 
 
 		 248 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>