34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2977 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  100 
 
 		 227 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  63.23 
 
 		 224 aa  279  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  61.54 
 
 		 221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  60.62 
 
 		 225 aa  271  7e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  62.26 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  64.62 
 
 		 221 aa  268  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  62.2 
 
 		 211 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  60 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  58.93 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  57.89 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  59.82 
 
 		 221 aa  244  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  60 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  53.33 
 
 		 220 aa  221  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  55.34 
 
 		 218 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  50 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  50.22 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  48.44 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  46.03 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  46.03 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  47.06 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  45.21 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0238  CRISPR-associated Cas5d family protein  39.24 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  41.43 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  41.35 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  39.84 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  39.51 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.77 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  27.23 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.06 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  30.91 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  27.14 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  25.9 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.79 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  30.3 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>