35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0656 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0656  CRISPR-associated Csd1 family protein  100 
 
 		 222 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0825  CRISPR-associated protein Cas5 family  63.39 
 
 		 221 aa  286  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1160  CRISPR-associated Cas5 family protein  64.79 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1296  CRISPR-associated Csd1 family protein  54.69 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1435  CRISPR-associated Cas5 family protein  55.28 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1065  CRISPR-associated Csd1 family protein  55.7 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0551157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0602  CRISPR-associated Cas5d family protein  56.76 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133599  normal  0.212171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31620  CRISPR-associated protein Cas5d  56.36 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1629  CRISPR-associated protein Cas5 family  55.56 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122898  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02700  crispr-associated protein Cas5, dvulg subtype  55.67 
 
 		 204 aa  218  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1003  CRISPR-associated Cas5 family protein  52.8 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0476  hypothetical protein  52.09 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1972  CRISPR-associated protein Cas5 family  50.88 
 
 		 221 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0829  CRISPR-associated RAMP Csd5d family protein  50.68 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1940  CRISPR-associated Csd1 family protein  52.17 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2977  CRISPR-associated Cas5 family protein  50.22 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1724  CRISPR-associated Cas5 family protein  52.4 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1658  CRISPR-associated protein Cas5 family  47.37 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1978  CRISPR-associated protein Cas5 family  45.12 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1477  CRISPR-associated protein Cas5 family  45.45 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0497  CRISPR-associated Csd1 family protein  47 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1488  Cas5 family CRISPR-associated protein  40 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.107953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3581  Cas5 family CRISPR-associated protein  40.91 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0238  CRISPR-associated Cas5d family protein  37.14 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3384  hypothetical protein  39.29 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3342  hypothetical protein  36.53 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00560307  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2183  CRISPR-associated protein Cas5  28.88 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4334  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.15 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683979  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1009  CRISPR-associated Csd1 family protein  26.34 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0797  CRISPR-associated protein Cas5  26.82 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3650  CRISPR-associated protein Cas5 family  22.02 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3902  CRISPR-associated Cas5d family protein  25.38 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3520  CRISPR-associated Cas5 family protein  23.42 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0849  hypothetical protein  23.39 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  32.89 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>