141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0188 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0188  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
343 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.406722  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  29.97 
 
 
321 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.66 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.59 
 
 
337 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  30.49 
 
 
344 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  27.67 
 
 
337 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  28.7 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  27.94 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  26.65 
 
 
329 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 
345 aa  92.8  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  28.52 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  27.19 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  26.18 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.29 
 
 
347 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.81 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  30.23 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  30.23 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  27.52 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  26.86 
 
 
349 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  28.23 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  25.5 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  27.67 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  28.48 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  29.84 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  28.79 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  29.82 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  29.18 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  28.39 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  25.08 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  28.65 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  27.84 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  23.72 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  28.01 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  25.08 
 
 
320 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  29.25 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  29.23 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  25.32 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  28.14 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  26.35 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  27.31 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  27.31 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  23.83 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  26.81 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  27.18 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  27.62 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  27.01 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  24.73 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  26.45 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.97 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  27.09 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  26.51 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.97 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  28.29 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  25.95 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  25.08 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  25.33 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  25.33 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  25.33 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  25.08 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  29.65 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  37.25 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  28.3 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  26.33 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.08 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.63 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  26.16 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  25.63 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  28.96 
 
 
300 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  23.99 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  23.94 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  25.96 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  23.51 
 
 
353 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  37.62 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  29.09 
 
 
343 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.33 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  29.71 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  24.46 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  24.13 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.57 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  28.73 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  24.28 
 
 
316 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10026  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11160)  25.53 
 
 
358 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558826  normal  0.219855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  27.59 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  27.59 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  27.59 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  23.76 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  30.65 
 
 
279 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  23.59 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  25.1 
 
 
333 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  26.79 
 
 
279 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  32.97 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  27.41 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  23.19 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  27.6 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  29.5 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>