More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0155 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0155  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0505  transposase IS66  77.24 
 
 		 577 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0881  transposase IS66  77.24 
 
 		 577 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2051  transposase IS66  77.24 
 
 		 577 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2073  transposase IS66  77.24 
 
 		 577 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2078  transposase IS66  77.24 
 
 		 577 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0408516  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4000  transposase IS66  77.24 
 
 		 577 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0144  transposase IS66  72.22 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.996772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1104  transposase IS66  58.09 
 
 		 405 aa  318  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.159368  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7048  transposase IS66  72.2 
 
 		 531 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0277  transposase IS66  48.13 
 
 		 546 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1922  transposase IS66  48.13 
 
 		 546 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  48.13 
 
 		 546 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2057  transposase IS66  47.76 
 
 		 546 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0517052  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2522  transposase IS66  47.76 
 
 		 546 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2533  transposase IS66  47.76 
 
 		 546 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2244  transposase IS66  25.91 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  28.72 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  28.72 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  28.72 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  28.72 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  28.72 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  28.72 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  28.72 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  28.41 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  28.1 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  25.91 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  25.91 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  25.91 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  25.91 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  25.91 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  27.44 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  28.03 
 
 		 694 aa  63.2  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  26.35 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  26.35 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  26.81 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  25.91 
 
 		 545 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  25.52 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  25.52 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  26.87 
 
 		 521 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  26.87 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  26.99 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  26.99 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  24.89 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  24.58 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  24.89 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  30.09 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  25.98 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  25.98 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  25.98 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01937  hypothetical protein  25.45 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  27.94 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00540  transposase  26.13 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  27.72 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  26.63 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02979  hypothetical protein  25.45 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  26.26 
 
 		 527 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01467  hypothetical protein  25 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3678  transposase IS66  27.27 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2336  transposase IS66  25.87 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  26.4 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02873  hypothetical protein  26.13 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06441  hypothetical protein  26.22 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06878  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  29.5 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06484  hypothetical protein  26.13 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06972  hypothetical protein  25 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05522  hypothetical protein  26.13 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0321  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000571248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0474  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.330634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0656  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.762551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0662  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0971394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0677  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1790  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0368561  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1976  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.212724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  25 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6577  transposase IS66  26.46 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154417  normal  0.0136754 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06792  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1982  transposase IS66  24.55 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.583264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2596  transposase IS66  24.55 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0682749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2521  transposase IS66  28.44 
 
 		 536 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538642  normal  0.424177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  27.43 
 
 		 545 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05822  hypothetical protein  25 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01658  hypothetical protein  25 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  24.68 
 
 		 506 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05068  hypothetical protein  25 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06402  hypothetical protein  25 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  24.68 
 
 		 506 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  24.68 
 
 		 506 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>