More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2533 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0277  transposase IS66  99.82 
 
 		 546 aa  1100    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  99.63 
 
 		 546 aa  1097    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1922  transposase IS66  99.82 
 
 		 546 aa  1100    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2057  transposase IS66  100 
 
 		 546 aa  1104    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0517052  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2522  transposase IS66  100 
 
 		 546 aa  1104    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2533  transposase IS66  100 
 
 		 546 aa  1104    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0505  transposase IS66  47.75 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0881  transposase IS66  47.75 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2051  transposase IS66  47.75 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2073  transposase IS66  47.75 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2078  transposase IS66  47.75 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0408516  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4000  transposase IS66  47.75 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0144  transposase IS66  45.93 
 
 		 570 aa  340  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.996772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7048  transposase IS66  46.07 
 
 		 531 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1104  transposase IS66  47.84 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.159368  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2244  transposase IS66  32.37 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0155  hypothetical protein  47.39 
 
 		 321 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  31.17 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  29.25 
 
 		 530 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  28.92 
 
 		 694 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  29.88 
 
 		 510 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  29.88 
 
 		 510 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  29.88 
 
 		 510 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  28.75 
 
 		 510 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  28.75 
 
 		 510 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  29.26 
 
 		 510 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  29.08 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  31.13 
 
 		 531 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  25.91 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  29.72 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  25.91 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  28.28 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  27.94 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  27.94 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  28.8 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  28.8 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  28.8 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  30.32 
 
 		 532 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  26.46 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  29.88 
 
 		 516 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  29.52 
 
 		 508 aa  144  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  27.2 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  30 
 
 		 581 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  30 
 
 		 581 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1274  transposase IS66  31.15 
 
 		 606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0129566 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  26.99 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>