More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0881 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0144  transposase IS66  73.58 
 
 		 570 aa  736    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.996772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0505  transposase IS66  100 
 
 		 577 aa  1155    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0881  transposase IS66  100 
 
 		 577 aa  1155    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2051  transposase IS66  100 
 
 		 577 aa  1155    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2073  transposase IS66  100 
 
 		 577 aa  1155    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2078  transposase IS66  100 
 
 		 577 aa  1155    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0408516  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4000  transposase IS66  100 
 
 		 577 aa  1155    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7048  transposase IS66  70.51 
 
 		 531 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1104  transposase IS66  65.98 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.159368  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0155  hypothetical protein  77.24 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  47.36 
 
 		 546 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0277  transposase IS66  47.36 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1922  transposase IS66  47.36 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2057  transposase IS66  47.16 
 
 		 546 aa  379  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0517052  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2522  transposase IS66  47.16 
 
 		 546 aa  379  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2533  transposase IS66  47.16 
 
 		 546 aa  379  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2244  transposase IS66  27.23 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  28.01 
 
 		 510 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  28.01 
 
 		 510 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  27.87 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  27.58 
 
 		 503 aa  127  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  27.25 
 
 		 506 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  27.25 
 
 		 506 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  27.25 
 
 		 506 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  27.96 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  27.85 
 
 		 522 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  27.32 
 
 		 523 aa  124  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  27.75 
 
 		 524 aa  124  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  27.04 
 
 		 510 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  29.18 
 
 		 581 aa  123  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  29.18 
 
 		 581 aa  123  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  26.85 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  26.85 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  26.85 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  27.32 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  26.96 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  27.32 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  27.32 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  27.32 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  27.32 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  26.73 
 
 		 515 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  26.73 
 
 		 515 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  27.37 
 
 		 510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  30.11 
 
 		 694 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6577  transposase IS66  25.75 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154417  normal  0.0136754 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6379  transposase IS66  27.37 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  29.01 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  26.75 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  29.72 
 
 		 530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  26.54 
 
 		 531 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  26.49 
 
 		 545 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  28.19 
 
 		 505 aa  117  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  28.19 
 
 		 505 aa  117  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  28.19 
 
 		 505 aa  117  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  26.77 
 
 		 545 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  26.77 
 
 		 545 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  28.36 
 
 		 508 aa  116  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  26.77 
 
 		 545 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  26.77 
 
 		 545 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>