More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0144 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0144  transposase IS66  100 
 
 		 570 aa  1131    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.996772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0505  transposase IS66  74.27 
 
 		 577 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0881  transposase IS66  74.27 
 
 		 577 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2051  transposase IS66  74.27 
 
 		 577 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2073  transposase IS66  74.27 
 
 		 577 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2078  transposase IS66  74.27 
 
 		 577 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0408516  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4000  transposase IS66  74.27 
 
 		 577 aa  771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7048  transposase IS66  68.22 
 
 		 531 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1104  transposase IS66  61.34 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.159368  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0155  hypothetical protein  72.22 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  46.91 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0277  transposase IS66  46.91 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1922  transposase IS66  46.91 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2057  transposase IS66  46.71 
 
 		 546 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0517052  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2522  transposase IS66  46.71 
 
 		 546 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2533  transposase IS66  46.71 
 
 		 546 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2244  transposase IS66  25.46 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  27.34 
 
 		 516 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  26.39 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  26.39 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  27.76 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  28.33 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  28.22 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  29.61 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  27.77 
 
 		 531 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  28.11 
 
 		 524 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  27 
 
 		 517 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  27.24 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  29.34 
 
 		 510 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  27.24 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  27.24 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  27.52 
 
 		 523 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  28.35 
 
 		 512 aa  133  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  28.85 
 
 		 694 aa  133  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  28.35 
 
 		 512 aa  133  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  28.35 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  27.52 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  27.52 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  27.52 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  27.52 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  27.52 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  27.62 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  27.21 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  27.72 
 
 		 523 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  26.35 
 
 		 545 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  28.63 
 
 		 530 aa  130  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  28.16 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  28.16 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  26.35 
 
 		 545 aa  130  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  28.16 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  26.35 
 
 		 545 aa  130  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  28.16 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  28.16 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  26.11 
 
 		 510 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  26.11 
 
 		 510 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  26.11 
 
 		 510 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  28.16 
 
 		 512 aa  130  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  28.16 
 
 		 512 aa  130  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  28.16 
 
 		 512 aa  130  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>