More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1104 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1104  transposase IS66  100 
 
 		 405 aa  810    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.159368  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0505  transposase IS66  66.23 
 
 		 577 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0881  transposase IS66  66.23 
 
 		 577 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2051  transposase IS66  66.23 
 
 		 577 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2073  transposase IS66  66.23 
 
 		 577 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2078  transposase IS66  66.23 
 
 		 577 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0408516  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4000  transposase IS66  66.23 
 
 		 577 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0144  transposase IS66  61.28 
 
 		 570 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.996772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7048  transposase IS66  61.49 
 
 		 531 aa  362  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0155  hypothetical protein  58.09 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  47.86 
 
 		 546 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2057  transposase IS66  47.73 
 
 		 546 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0517052  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2522  transposase IS66  47.73 
 
 		 546 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2533  transposase IS66  47.73 
 
 		 546 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0277  transposase IS66  47.73 
 
 		 546 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1922  transposase IS66  47.73 
 
 		 546 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2244  transposase IS66  27.76 
 
 		 480 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275686 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4534  transposase IS66  28.28 
 
 		 532 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  29.1 
 
 		 531 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  27.64 
 
 		 532 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2521  transposase IS66  27.39 
 
 		 536 aa  86.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538642  normal  0.424177 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  29.3 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  25.37 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  28.79 
 
 		 694 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6577  transposase IS66  25.32 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154417  normal  0.0136754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  25.19 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  25.7 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6840  transposase IS66  25 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  25.7 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  25.66 
 
 		 529 aa  83.2  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  25.7 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  25.06 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  25.06 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  25.06 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  25.06 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4919  transposase IS66  24.62 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  24.69 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  24.69 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  26.7 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  26.7 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  26.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  27.78 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  26.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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