More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4534 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1412  transposase IS66  74.29 
 
 
531 aa  792    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3092  transposase IS66  74.29 
 
 
531 aa  792    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6183  transposase IS66  62.6 
 
 
532 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6577  transposase IS66  60.19 
 
 
518 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154417  normal  0.0136754 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4534  transposase IS66  100 
 
 
532 aa  1080    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2521  transposase IS66  92.54 
 
 
536 aa  1002    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538642  normal  0.424177 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6840  transposase IS66  60.69 
 
 
518 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6379  transposase IS66  59.85 
 
 
531 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4919  transposase IS66  55.92 
 
 
526 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73176  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  45.83 
 
 
515 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  45.83 
 
 
515 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0321  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000571248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0474  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.330634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0656  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.762551  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0662  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0971394  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0677  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607766  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1790  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0368561  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1976  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.212724  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  44.34 
 
 
526 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  43.95 
 
 
526 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  43.95 
 
 
526 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  42.88 
 
 
694 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  43.08 
 
 
530 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  42.58 
 
 
530 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  45.31 
 
 
510 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  43.05 
 
 
506 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  45.31 
 
 
510 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  43.05 
 
 
506 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  43.05 
 
 
506 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  42.21 
 
 
503 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  45.12 
 
 
581 aa  359  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  45.12 
 
 
581 aa  359  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  43.9 
 
 
520 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  43.93 
 
 
522 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2632  transposase IS66  44.79 
 
 
488 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0406553  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  48.82 
 
 
524 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  42.24 
 
 
517 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  42.65 
 
 
510 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  42.65 
 
 
510 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  42.65 
 
 
510 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  42.65 
 
 
510 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  41.58 
 
 
514 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  41.39 
 
 
514 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  38.1 
 
 
516 aa  320  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  38.1 
 
 
516 aa  320  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  42.15 
 
 
544 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0065  putative transposase  42.26 
 
 
526 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0077  putative ISPpu13, transposase Orf2  42.26 
 
 
526 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3736  putative transposase  42.26 
 
 
526 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2596  transposase IS66  46.05 
 
 
381 aa  306  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0682749  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4744  transposase IS66  39.62 
 
 
546 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  36.71 
 
 
523 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  36.06 
 
 
530 aa  292  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  36.06 
 
 
530 aa  292  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  36.51 
 
 
523 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  37.14 
 
 
529 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>