More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7048 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0505  transposase IS66  70.51 
 
 
577 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0881  transposase IS66  70.51 
 
 
577 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2051  transposase IS66  70.51 
 
 
577 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2073  transposase IS66  70.51 
 
 
577 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2078  transposase IS66  70.51 
 
 
577 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0408516  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4000  transposase IS66  70.51 
 
 
577 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7048  transposase IS66  100 
 
 
531 aa  1062    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652427  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0144  transposase IS66  68.97 
 
 
570 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.996772  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1104  transposase IS66  61.37 
 
 
405 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.159368  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  46.41 
 
 
546 aa  340  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0277  transposase IS66  46.41 
 
 
546 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1922  transposase IS66  46.41 
 
 
546 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2057  transposase IS66  46.2 
 
 
546 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0517052  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2522  transposase IS66  46.2 
 
 
546 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2533  transposase IS66  46.2 
 
 
546 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0155  hypothetical protein  72.2 
 
 
321 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2244  transposase IS66  25.7 
 
 
480 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  26.96 
 
 
503 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  26.34 
 
 
510 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  26.34 
 
 
510 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  26.34 
 
 
506 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  26.34 
 
 
506 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  26.34 
 
 
506 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1274  transposase IS66  27.84 
 
 
606 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0129566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  25.45 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  25.32 
 
 
517 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  27.47 
 
 
508 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  27.7 
 
 
694 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  25.58 
 
 
520 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  25.4 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  25.4 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  25.4 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  27.25 
 
 
512 aa  99.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  26.4 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  26.4 
 
 
523 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  26.4 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  26.4 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  26.4 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  26.4 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  27.25 
 
 
512 aa  99.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  25.84 
 
 
512 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  25.47 
 
 
522 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  27.33 
 
 
530 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  27.25 
 
 
512 aa  100  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  25.37 
 
 
524 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  26.46 
 
 
523 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2521  transposase IS66  26.38 
 
 
536 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538642  normal  0.424177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  25.17 
 
 
510 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  25.16 
 
 
520 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  26.61 
 
 
512 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  24.95 
 
 
516 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>