More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0556 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  100 
 
 
523 aa  1077    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  99.62 
 
 
523 aa  1071    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  51.06 
 
 
524 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  51.06 
 
 
524 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  50.38 
 
 
524 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  50.57 
 
 
524 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  43.84 
 
 
537 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  44.33 
 
 
529 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  42.86 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  44.93 
 
 
505 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  44.93 
 
 
505 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  44.93 
 
 
505 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  41.94 
 
 
520 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  41.94 
 
 
520 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  38.74 
 
 
527 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  39.55 
 
 
530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  54.38 
 
 
290 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  54.38 
 
 
290 aa  306  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  54.38 
 
 
290 aa  306  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  35.53 
 
 
508 aa  301  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  36.38 
 
 
539 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  36.59 
 
 
523 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  36.59 
 
 
523 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  36.59 
 
 
523 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  36.59 
 
 
523 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  36.59 
 
 
523 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  37.65 
 
 
523 aa  294  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  36.38 
 
 
520 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  36.02 
 
 
523 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  36.23 
 
 
532 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  37.23 
 
 
491 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  35.56 
 
 
516 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  38 
 
 
513 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  38 
 
 
523 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  35.04 
 
 
531 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  37.85 
 
 
523 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  38.46 
 
 
556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  35.76 
 
 
514 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  279  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  279  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  279  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  279  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  35.63 
 
 
512 aa  279  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  35.43 
 
 
512 aa  277  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  35.43 
 
 
512 aa  277  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  33.76 
 
 
533 aa  276  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  35.22 
 
 
512 aa  276  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  37.09 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  37.89 
 
 
537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  37.09 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  35.98 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  35.32 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  35.32 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  35.32 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  35.32 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  35.32 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  35.32 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  35.32 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  35.32 
 
 
512 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  34.42 
 
 
527 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  34.42 
 
 
527 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  35.66 
 
 
530 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  35.79 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  35.66 
 
 
530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  35.66 
 
 
530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>