More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0071 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0005  16S ribosomal RNA  99.87 
 
 		 1519 bp  2995    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r07731  16S ribosomal RNA  88.27 
 
 		 1521 bp  1493    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r13674  16S ribosomal RNA  88.27 
 
 		 1521 bp  1493    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0040  16S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 1514 bp  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0677845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0030  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1514 bp  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0018  16S ribosomal RNA  88.42 
 
 		 1509 bp  1590    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0051  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1519 bp  2977    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0050  16S ribosomal RNA  88.42 
 
 		 1509 bp  1590    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0034  16S ribosomal RNA  88.42 
 
 		 1509 bp  1590    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0019  16S ribosomal RNA  99.87 
 
 		 1519 bp  2995    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0027  16S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 1514 bp  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0024  16S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 1514 bp  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0042  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1514 bp  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0160041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0035  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1514 bp  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0012  16S ribosomal RNA  88.42 
 
 		 1509 bp  1590    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.513424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0045  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1519 bp  2977    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0071  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1519 bp  3011    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0057  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1519 bp  2977    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.906516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0055  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0011  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0049  16S ribosomal RNA  84.13 
 
 		 1510 bp  504  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0009  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1515 bp  444  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0004  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 1495 bp  391  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000518712  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0020  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 1495 bp  391  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127613  normal  0.0141426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0053  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 1495 bp  391  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000916534  normal  0.0303457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0043  16S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 1495 bp  391  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000158022  normal  0.338692 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SA  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 1475 bp  369  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00161199 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SB  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 1475 bp  369  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SC  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 1475 bp  369  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SD  16S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 1475 bp  369  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0025  16S ribosomal RNA  80.87 
 
 		 1495 bp  347  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643168  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0022  16S ribosomal RNA  80.87 
 
 		 1495 bp  347  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0034  16S ribosomal RNA  80.87 
 
 		 1495 bp  347  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0013  16S ribosomal RNA  80.9 
 
 		 1495 bp  333  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204924  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0006  16S ribosomal RNA  85 
 
 		 1528 bp  309  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S01  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1382 bp  295  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0232245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S02  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1382 bp  295  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S03  16S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 1382 bp  295  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1532 bp  266  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1532 bp  266  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1512 bp  248  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1512 bp  248  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1538 bp  242  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1538 bp  242  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr01  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1509 bp  242  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr04  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1509 bp  242  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr09  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1509 bp  242  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr01  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1509 bp  242  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr04  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1509 bp  242  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr09  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1509 bp  242  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1543 bp  240  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  83.84 
 
 		 1543 bp  240  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 1501 bp  232  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 1501 bp  232  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 1501 bp  232  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SD  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1518 bp  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0245595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SF  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1518 bp  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SG  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1518 bp  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 1473 bp  226  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 1473 bp  226  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0007  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1528 bp  226  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R05  16S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 2528 bp  226  9.999999999999999e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0049  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1363 bp  226  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000340062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0052  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1364 bp  226  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000418748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0026  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1524 bp  226  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0013  16S ribosomal RNA  88.05 
 
 		 1524 bp  226  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0008  16S ribosomal RNA  88.18 
 
 		 1495 bp  224  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.291877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0003  16S ribosomal RNA  88.18 
 
 		 1495 bp  224  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0003  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1495 bp  222  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 1532 bp  220  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0003  16S ribosomal RNA  88.13 
 
 		 1495 bp  220  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000311763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0008  16S ribosomal RNA  88.13 
 
 		 1495 bp  220  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0023  16S ribosomal RNA  88.13 
 
 		 1495 bp  220  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0003  16S ribosomal RNA  88.13 
 
 		 1494 bp  220  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 1532 bp  220  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 1532 bp  220  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 1532 bp  220  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0008  16S ribosomal RNA  88.13 
 
 		 1494 bp  220  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00811076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0034  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1514 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0043  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1512 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0049  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1514 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.464241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0339  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1512 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0345  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1514 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0556  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1512 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0562  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1514 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1609  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1512 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.48618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3907  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1512 bp  218  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R12  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1527 bp  218  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000170255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R41  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1527 bp  218  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R60  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1527 bp  218  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000806455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R81  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1527 bp  218  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231997  normal  0.0102575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R94  16S ribosomal RNA  83.61 
 
 		 1527 bp  218  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000210152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0432  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1538 bp  216  1e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0002  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1523 bp  214  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0092  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1523 bp  214  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00736494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0071  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1523 bp  214  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121769  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_r1  16S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 1509 bp  214  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0066  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1523 bp  214  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.043878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0086  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1523 bp  214  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0165125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0089  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1523 bp  214  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00770001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>