More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0009 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0009  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1515 bp  3003    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S01  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1382 bp  571  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0232245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S02  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1382 bp  571  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S03  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1382 bp  571  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0024  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 		 1514 bp  521  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0030  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 		 1514 bp  521  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0042  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 		 1514 bp  521  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0160041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0027  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 		 1514 bp  521  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0035  16S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 1514 bp  505  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0040  16S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 1514 bp  505  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0677845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0034  16S ribosomal RNA  82.89 
 
 		 1495 bp  454  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0022  16S ribosomal RNA  82.89 
 
 		 1495 bp  454  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0025  16S ribosomal RNA  82.89 
 
 		 1495 bp  454  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643168  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r07731  16S ribosomal RNA  82.72 
 
 		 1521 bp  452  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r13674  16S ribosomal RNA  82.72 
 
 		 1521 bp  452  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0071  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1519 bp  444  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0051  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1519 bp  444  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0005  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1519 bp  444  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0045  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1519 bp  444  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0057  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1519 bp  444  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.906516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0019  16S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 1519 bp  444  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0011  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1510 bp  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0049  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1510 bp  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0055  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1510 bp  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SA  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1475 bp  375  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00161199 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SB  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1475 bp  375  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SC  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1475 bp  375  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SD  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1475 bp  375  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0013  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1495 bp  359  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204924  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0053  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 1495 bp  345  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000916534  normal  0.0303457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0020  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 1495 bp  345  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127613  normal  0.0141426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0043  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 1495 bp  345  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000158022  normal  0.338692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0004  16S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 1495 bp  345  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000518712  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0006  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1528 bp  319  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0050  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1509 bp  307  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0034  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1509 bp  307  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0018  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1509 bp  307  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0012  16S ribosomal RNA  86.07 
 
 		 1509 bp  307  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.513424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 1473 bp  289  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 1473 bp  289  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0003  16S ribosomal RNA  83.47 
 
 		 1495 bp  283  7e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 1543 bp  280  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 1543 bp  280  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 1543 bp  280  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  82.54 
 
 		 1543 bp  280  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0049  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1523 bp  272  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0054  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1523 bp  272  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  82.45 
 
 		 1548 bp  270  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  82.45 
 
 		 1548 bp  270  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  82.45 
 
 		 1548 bp  270  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  82.45 
 
 		 1548 bp  270  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0049  16S ribosomal RNA  80.27 
 
 		 1363 bp  266  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000340062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0052  16S ribosomal RNA  80.27 
 
 		 1364 bp  266  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000418748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0016  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1527 bp  266  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.656553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0008  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1527 bp  266  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1538 bp  262  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1538 bp  262  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1537 bp  262  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1538 bp  262  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0052  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1522 bp  258  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0009  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1522 bp  258  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241924  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0011  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1517 bp  258  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205887  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0048  16S ribosomal RNA  82.2 
 
 		 1484 bp  258  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0058  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1517 bp  258  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355674  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0069  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1517 bp  258  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0042  16S ribosomal RNA  86.15 
 
 		 1527 bp  258  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0062  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1522 bp  258  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.746393  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0053  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1531 bp  252  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0058  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1531 bp  252  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr01  16S ribosomal RNA  84.08 
 
 		 1509 bp  248  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr04  16S ribosomal RNA  84.08 
 
 		 1509 bp  248  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr09  16S ribosomal RNA  84.08 
 
 		 1509 bp  248  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr01  16S ribosomal RNA  84.08 
 
 		 1509 bp  248  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr04  16S ribosomal RNA  84.08 
 
 		 1509 bp  248  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr09  16S ribosomal RNA  84.08 
 
 		 1509 bp  248  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0007  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1540 bp  242  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  unclonable  0.000000000443158  hitchhiker  0.00339751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0085  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1540 bp  242  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000770905  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0006  16S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 1522 bp  242  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000463074  normal  0.838643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0090  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1540 bp  242  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000161015  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0065  16S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 1522 bp  242  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0055  16S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 1522 bp  242  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0002  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1540 bp  242  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153302  normal  0.0205506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1471 bp  238  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1471 bp  238  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0044  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1528 bp  234  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.256781  normal  0.169307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0030  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 1526 bp  228  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0093  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 1526 bp  228  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0098  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 1526 bp  228  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00051751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0013  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 1526 bp  228  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152184  decreased coverage  0.00167903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0008  16S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 1526 bp  228  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00875237  normal  0.0127066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r01  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1518 bp  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.380261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r04  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1518 bp  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00569348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r07  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1518 bp  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r12  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1518 bp  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r15  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1518 bp  226  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.011004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  83.07 
 
 		 1535 bp  226  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  83.07 
 
 		 1535 bp  226  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0008  16S ribosomal RNA  87.19 
 
 		 1495 bp  224  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.291877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0003  16S ribosomal RNA  87.19 
 
 		 1495 bp  224  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0053  16S ribosomal RNA  87.6 
 
 		 1494 bp  224  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000661064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>