More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_r16S02 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_R0025  16S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 1495 bp  918    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643168  normal  0.762156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0011  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 1510 bp  1082    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0049  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 1510 bp  1082    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0055  16S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 1510 bp  1082    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S01  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1382 bp  2740    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0232245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S02  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1382 bp  2740    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_r16S03  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1382 bp  2740    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0022  16S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 1495 bp  918    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0013  16S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 1495 bp  918    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204924  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0034  16S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 1495 bp  918    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0009  16S ribosomal RNA  84.55 
 
 		 1515 bp  571  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0020  16S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 1495 bp  555  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127613  normal  0.0141426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0004  16S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 1495 bp  555  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000518712  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0043  16S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 1495 bp  555  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000158022  normal  0.338692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0053  16S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 1495 bp  555  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000916534  normal  0.0303457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0030  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1514 bp  428  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0024  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1514 bp  428  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0027  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1514 bp  428  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0042  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1514 bp  428  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0160041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0035  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1514 bp  420  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0040  16S ribosomal RNA  83.53 
 
 		 1514 bp  420  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0677845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0001  16S ribosomal RNA  88.22 
 
 		 1519 bp  375  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0020  16S ribosomal RNA  88.22 
 
 		 1504 bp  375  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0056  16S ribosomal RNA  88.22 
 
 		 1489 bp  375  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0079  16S ribosomal RNA  88.22 
 
 		 1501 bp  375  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna044  16S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 1546 bp  361  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000863087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna052  16S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 1546 bp  361  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000100812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna038  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00135827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna078  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000401471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna029  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000111859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna028  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000605333  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna158  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00164008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna085  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000489911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna055  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna015  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna074  16S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 1546 bp  353  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000120652  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3136r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000277636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3074r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00892956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3110r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.624982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3184r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0389329  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3212r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00174392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3191r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00140293  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3071r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000353761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3085r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0262386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3079r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1536 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0002482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3107r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0030907  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3092r  16S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 1537 bp  345  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.910429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1543 bp  343  8e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1543 bp  343  8e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1120r  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1537 bp  337  5e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00900517  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00254  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00198  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00204  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00464  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03618  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01008  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00379  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06832  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03722  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r07731  16S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 1521 bp  337  5e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_r13674  16S ribosomal RNA  81.37 
 
 		 1521 bp  337  5e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00331  16S ribosomal RNA  87.43 
 
 		 1565 bp  337  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0005  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1531 bp  329  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000361753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0100  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1531 bp  329  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0095  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1531 bp  329  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000583009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0080  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1531 bp  329  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000754087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0088  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1531 bp  329  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000434515  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG16SA  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1475 bp  325  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00161199 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SB  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1475 bp  325  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SC  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1475 bp  325  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_002950  PG16SD  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 1475 bp  325  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1496 bp  323  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1497 bp  323  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 1497 bp  323  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0061  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1531 bp  321  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00412662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0015  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1531 bp  321  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0021744  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4511  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00904207  normal  0.512645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4464  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00131676  hitchhiker  0.0000000000183145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4222  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00108755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4116  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00638866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2988  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000444401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0001  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000282718  hitchhiker  0.000910883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0007  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150491  normal  0.406366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0016  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201681  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0071  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0123  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0163335  normal  0.34966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0132  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261242  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0136  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000885648  hitchhiker  0.000140032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0140  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00248839  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0143  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000577207  normal  0.0309772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0001  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00134291  hitchhiker  0.00347665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0026  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0396739  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0144  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1535 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0816172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4172  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00219023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130  16S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 1555 bp  313  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0100831  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4509  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00650936  normal  0.0273427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4461  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00798027  hitchhiker  0.0013026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0291  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1532 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000859505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2854  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00100225  normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0272  16S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 1534 bp  313  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0079312  normal  0.924618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>