More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0038 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  86.35 
 
 		 1548 bp  944    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  86.35 
 
 		 1548 bp  944    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1473 bp  720    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1473 bp  720    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1612 bp  795    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0073  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1537 bp  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0043  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 		 1460 bp  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  88.08 
 
 		 1538 bp  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1562 bp  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r001  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r004  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r007  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r012  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r015  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r018  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r021  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r024  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r027  16S ribosomal RNA  84.36 
 
 		 1529 bp  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1551 bp  973    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1551 bp  973    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1708  16S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 1549 bp  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0138  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1537 bp  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000622632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0022  16S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 1537 bp  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000152089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 1612 bp  803    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0117  16S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 1537 bp  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000829511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0163  16S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 1549 bp  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0633257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0017  16S ribosomal RNA  86.42 
 
 		 1460 bp  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.959999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1496 bp  2958    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1497 bp  2968    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1835  16S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 1549 bp  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.364981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0019  16S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 1549 bp  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.163804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1551 bp  973    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  87.78 
 
 		 1538 bp  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1551 bp  973    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1497 bp  2968    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0133  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000510938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0008  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1537 bp  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000302643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0129  16S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 1537 bp  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000475348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0142  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1537 bp  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000521528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1510 bp  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0121  16S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 1537 bp  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0004  16S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 1537 bp  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000257645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1612 bp  795    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1612 bp  795    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1491 bp  731    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 1491 bp  731    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1548 bp  924    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1548 bp  924    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 1612 bp  803    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1507 bp  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 1612 bp  803    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0001  16S ribosomal RNA  83.66 
 
 		 1537 bp  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000407555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0128  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000157224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0121  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000475957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0061  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000486947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 1507 bp  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0030  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000656968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 1477 bp  1142    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 1477 bp  1142    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 1477 bp  1142    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 1477 bp  1142    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  85.62 
 
 		 1555 bp  716    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 		 1542 bp  833    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 		 1542 bp  833    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0001  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000556781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0007  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000706702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0015  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0044  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1533 bp  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000361532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0107  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0119  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1533 bp  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0122  16S ribosomal RNA  84.49 
 
 		 1535 bp  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0472105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0127  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0086  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1455 bp  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0059  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1455 bp  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.831402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0063  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1455 bp  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0071  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1455 bp  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0002  16S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 1455 bp  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0087575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0001  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1531 bp  690    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000169923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0008  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1531 bp  690    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0016  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1531 bp  690    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000811527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0023  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1531 bp  690    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000872665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0083  16S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 1531 bp  690    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000766341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0001  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1535 bp  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000282718  hitchhiker  0.000910883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0026  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1535 bp  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0396739  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0144  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1535 bp  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0816172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  88.82 
 
 		 1532 bp  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  88.82 
 
 		 1532 bp  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0001  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0004  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000248814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0013  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0027  16S ribosomal RNA  84.46 
 
 		 1535 bp  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000222685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>