More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_R0055 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_16SA  16S ribosomal RNA  84.99 
 
 		 1518 bp  821    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00652559  hitchhiker  0.0000964592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SB  16S ribosomal RNA  84.99 
 
 		 1518 bp  821    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  hitchhiker  0.000075441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SC  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1518 bp  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0265668  normal  0.0523023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SD  16S ribosomal RNA  84.99 
 
 		 1518 bp  821    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0245595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SE  16S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 1518 bp  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197165  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SF  16S ribosomal RNA  84.99 
 
 		 1518 bp  821    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SG  16S ribosomal RNA  84.99 
 
 		 1518 bp  821    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 1473 bp  805    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 1473 bp  805    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00481  16S ribosomal RNA  88.6 
 
 		 1513 bp  1602    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05580  16S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 1534 bp  1631    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000356691  normal  0.21036 
 
 
-
 
NC_003295  RS05737  16S ribosomal RNA  88.6 
 
 		 1513 bp  1602    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000227304  normal  0.62291 
 
 
-
 
NC_003296  RS05422  ribosomal RNA-16S  88.71 
 
 		 1534 bp  1631    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000685174  normal  0.144485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r01  16S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 1518 bp  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.380261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r04  16S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 1518 bp  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00569348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r07  16S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 1518 bp  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r12  16S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 1518 bp  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r15  16S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 1518 bp  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.011004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_16s_rrsA  16S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 1488 bp  1675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000103024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_16s_rrsB  16S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 1488 bp  1667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000527918  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm16SC  16S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 1488 bp  1675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000559741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm16SD  16S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 1488 bp  1675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000941939  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0002  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 1530 bp  1602    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000222771  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0018  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 1530 bp  1602    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.27678e-17  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0027  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 1530 bp  1602    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.8382e-16  unclonable  0.000000115774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0039  16S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 1530 bp  1602    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.88908e-17  normal  0.953363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0020  16S ribosomal RNA  89.88 
 
 		 1528 bp  1772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0174922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0053  16S ribosomal RNA  89.88 
 
 		 1528 bp  1772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0063  16S ribosomal RNA  89.88 
 
 		 1528 bp  1772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000907216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0070  16S ribosomal RNA  89.88 
 
 		 1528 bp  1772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0078  16S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 1528 bp  1739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0108744  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0083  16S ribosomal RNA  89.88 
 
 		 1528 bp  1772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0009  16S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 1503 bp  1487    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.00000000257641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0041  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1510 bp  1497    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0005  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1488 bp  1683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000129468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1473  16S ribosomal RNA  89.59 
 
 		 1488 bp  1691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000153483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3562  16S ribosomal RNA  89.59 
 
 		 1488 bp  1691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331816  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1908  16S ribosomal RNA  89.59 
 
 		 1488 bp  1691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344763  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0084  16S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 1480 bp  1703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000351388  normal  0.142421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0011  16S ribosomal RNA  89.72 
 
 		 1480 bp  1679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0015  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1480 bp  1719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0025  16S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 1480 bp  1703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404244  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0075  16S ribosomal RNA  90.13 
 
 		 1480 bp  1727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694489  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0001  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1480 bp  1719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000508168  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0012  16S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 1529 bp  1594    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000403377  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2047  16S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 1489 bp  1693    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000488111  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1096  16S ribosomal RNA  89.72 
 
 		 1488 bp  1707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2898  16S ribosomal RNA  89.72 
 
 		 1488 bp  1707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000172238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3095  16S ribosomal RNA  89.72 
 
 		 1488 bp  1707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0053  16S ribosomal RNA  94.77 
 
 		 1531 bp  2375    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0058  16S ribosomal RNA  94.77 
 
 		 1531 bp  2375    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0002  16S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 1466 bp  860    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000162067  normal  0.428716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0057  16S ribosomal RNA  86.28 
 
 		 1466 bp  860    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000060523  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0044  16S ribosomal RNA  94.11 
 
 		 1528 bp  2294    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.256781  normal  0.169307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0025  16S ribosomal RNA  90 
 
 		 1490 bp  1697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000584226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0074  16S ribosomal RNA  90 
 
 		 1490 bp  1697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000757328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0084  16S ribosomal RNA  90 
 
 		 1490 bp  1697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000010829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0001  16S ribosomal RNA  90 
 
 		 1490 bp  1697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000273638  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0007  16S ribosomal RNA  90 
 
 		 1490 bp  1697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187832  normal  0.20635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0012  16S ribosomal RNA  90 
 
 		 1490 bp  1697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000135641  normal  0.0289138 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0001  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000556781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0007  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000706702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0015  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0044  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1533 bp  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000361532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0107  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0119  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1533 bp  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0127  16S ribosomal RNA  84.27 
 
 		 1535 bp  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0054  16S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 1527 bp  1719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00023003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0064  16S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 1527 bp  1719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000114469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0070  16S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 1527 bp  1719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0075  16S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 1527 bp  1719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000293987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0002  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1526 bp  1792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000139239  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0040  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1527 bp  1786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000422035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0055  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1526 bp  1792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000262376  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0066  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1527 bp  1786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000961074  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0071  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1526 bp  1792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000358619  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0083  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1526 bp  1792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000003607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 1532 bp  1009    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  85 
 
 		 1532 bp  1017    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0001  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0004  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000248814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0013  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0027  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000222685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0030  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000656968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0061  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000486947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0121  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000475957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0128  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000157224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0133  16S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 1535 bp  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000510938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0003  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1526 bp  1816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000145483  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0007  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1526 bp  1792    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000074395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0017  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1526 bp  1800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000179112  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0067  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1526 bp  1792    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000751539  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0084  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1526 bp  1800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000608912  normal  0.0264011 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0090  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1526 bp  1800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000114709  normal  0.794618 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0003  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1536 bp  1792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000117489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0007  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1536 bp  1792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000560463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0016  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1536 bp  1792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000390781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0065  16S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 1536 bp  1792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000935197  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0081  16S ribosomal RNA  90.13 
 
 		 1478 bp  1725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115486  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0082  16S ribosomal RNA  90.13 
 
 		 1478 bp  1725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000337138  normal  0.0111555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>