More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R05 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_R05  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 2528 bp  5011    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr01  16S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 1528 bp  803    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr04  16S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 1528 bp  803    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R06  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2733 bp  1554    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0378  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 1524 bp  803    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0831  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1524 bp  787    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0019  16S ribosomal RNA  81.07 
 
 		 1549 bp  573  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.163804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1835  16S ribosomal RNA  81.07 
 
 		 1549 bp  573  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.364981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1708  16S ribosomal RNA  81.07 
 
 		 1549 bp  573  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0163  16S ribosomal RNA  81.07 
 
 		 1549 bp  573  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0633257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  81.39 
 
 		 1525 bp  440  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0016  16S ribosomal RNA  81.39 
 
 		 1525 bp  440  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0007  16S ribosomal RNA  81.65 
 
 		 1528 bp  383  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0026  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1502 bp  353  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0001  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1502 bp  353  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000922147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0056  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1502 bp  353  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0029  16S ribosomal RNA  87.67 
 
 		 1502 bp  353  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000355338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  80.93 
 
 		 1587 bp  351  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  80.77 
 
 		 1587 bp  351  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  80.77 
 
 		 1587 bp  351  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  80.89 
 
 		 1587 bp  349  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  80.89 
 
 		 1587 bp  349  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0034  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1514 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0043  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1512 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0049  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1514 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.464241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0339  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1512 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0345  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1514 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0556  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1512 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0562  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1514 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1609  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1512 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.48618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3907  16S ribosomal RNA  80.65 
 
 		 1512 bp  345  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  80.66 
 
 		 1587 bp  343  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0017  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1555 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000010305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  83.13 
 
 		 1554 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0081  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1545 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.621558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0017  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1545 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00979758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0067  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1562 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0020  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1555 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0081  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1562 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  80.72 
 
 		 1526 bp  325  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0021  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1545 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0005  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1545 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.328307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0070  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1545 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0067  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1545 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0070  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1562 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0005  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1555 bp  325  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.535884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 1544 bp  319  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  82.94 
 
 		 1544 bp  319  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1522 bp  319  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1517 bp  319  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1522 bp  319  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1522 bp  319  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1522 bp  319  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1522 bp  319  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  83.83 
 
 		 1522 bp  319  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 		 1554 bp  317  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 		 1554 bp  317  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 		 1554 bp  317  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 		 1554 bp  317  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  79.87 
 
 		 1538 bp  317  9e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1518 bp  317  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1518 bp  317  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  82.76 
 
 		 1544 bp  311  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 1522 bp  311  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 1522 bp  311  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  82.79 
 
 		 1554 bp  309  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0275  16S ribosomal RNA  79.63 
 
 		 1457 bp  309  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000373159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  83.23 
 
 		 1543 bp  309  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  83.23 
 
 		 1543 bp  309  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1917  Small Subunit Ribosomal RNA; ssuRNA; 16S ribosomal RNA  80.39 
 
 		 1457 bp  305  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1501 bp  303  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1510 bp  303  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1501 bp  303  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1555 bp  303  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1507 bp  303  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  86.18 
 
 		 1501 bp  303  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1508 bp  295  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1509 bp  295  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1508 bp  295  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1510 bp  295  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1510 bp  295  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1510 bp  295  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1509 bp  295  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1510 bp  295  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1510 bp  295  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1509 bp  295  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1510 bp  295  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1510 bp  295  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1503 bp  295  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1510 bp  295  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>