More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0056 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_R0015  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 
1506 bp  1578    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0056  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1502 bp  2977    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947732  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0051  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 
1506 bp  1578    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0001  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1502 bp  2977    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000922147  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0009  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 
1506 bp  1578    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0037  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 
1506 bp  1578    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0026  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1502 bp  2977    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844222  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0057  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 
1506 bp  1578    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0029  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1502 bp  2977    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000355338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5675  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0208  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000398584  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5231  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  hitchhiker  0.0000000000104089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4997  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.544547  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4781  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00045189  hitchhiker  0.000000313025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5642  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0485658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5313  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130141  normal 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1510 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1510 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1510 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1510 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4582  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00856308  normal  0.0343893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5013  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1518  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5007  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5822  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5289  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0602543  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5152  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400545  hitchhiker  0.00430273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5677  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5647  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.227305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5041  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000406275  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5616  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.162347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5623  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00151087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1507 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1507 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1507 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1507 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4991  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167942  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5630  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0540044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5019  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.03826  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5682  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5691  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0190899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5688  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5685  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.137206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5694  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0644845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5703  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1509 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 
1545 bp  498  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  85.39 
 
 
1530 bp  494  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  85.39 
 
 
1689 bp  494  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5722  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1509 bp  490  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0170559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0595  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1508 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1510 bp  490  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0849  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1509 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000507792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0330  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1508 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00177691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1507 bp  490  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1507 bp  490  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0184  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1508 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000878132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0007  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1509 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0324  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1508 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000098756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0341  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1509 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5038  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1509 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000228353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0356  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1509 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0079994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5664  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1509 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0347  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1509 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0567858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0031  16S ribosomal RNA  87.02 
 
 
1508 bp  490  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000247217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  84.93 
 
 
1502 bp  488  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1509 bp  482  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1508 bp  482  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1508 bp  482  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1562 bp  482  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1509 bp  482  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1555 bp  482  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1510 bp  482  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1510 bp  482  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1510 bp  482  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1510 bp  482  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1510 bp  482  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 
1507 bp  482  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>