More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0057 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0015  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1506 bp  2985    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0057  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1506 bp  2985    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0051  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1506 bp  2985    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0001  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 		 1502 bp  1578    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000922147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0026  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 		 1502 bp  1578    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0029  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 		 1502 bp  1578    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000355338  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0056  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 		 1502 bp  1578    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947732  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0009  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1506 bp  2985    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0037  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1506 bp  2985    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 1689 bp  505  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 1502 bp  505  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 1530 bp  505  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1548 bp  500  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1548 bp  500  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1548 bp  500  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1548 bp  500  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1548 bp  500  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 1548 bp  500  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  84.83 
 
 		 1563 bp  474  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  84.83 
 
 		 1563 bp  474  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1543 bp  452  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1543 bp  452  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1543 bp  452  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1543 bp  452  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  84.28 
 
 		 1545 bp  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1548 bp  440  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 1548 bp  440  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  82.89 
 
 		 1556 bp  440  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1548 bp  434  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1548 bp  434  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1548 bp  434  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 1551 bp  434  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 1551 bp  434  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1548 bp  434  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 1548 bp  434  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1548 bp  434  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1550 bp  432  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  82.59 
 
 		 1550 bp  432  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 1562 bp  428  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 1555 bp  428  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1551 bp  424  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1551 bp  424  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1551 bp  424  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 1551 bp  424  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5616  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.162347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5289  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0602543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5152  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400545  hitchhiker  0.00430273 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5313  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5630  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0540044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5623  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00151087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5675  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5703  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5694  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0644845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5822  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0208  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000398584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4582  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00856308  normal  0.0343893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4781  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00045189  hitchhiker  0.000000313025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4991  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5007  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4997  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.544547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5013  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5019  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.03826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5041  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000406275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5231  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  hitchhiker  0.0000000000104089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5647  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.227305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5685  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.137206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5682  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5642  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0485658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5691  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0190899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5688  16S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 1509 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  85.32 
 
 		 1496 bp  418  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0324  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1508 bp  418  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000098756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  85.32 
 
 		 1497 bp  418  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  85.32 
 
 		 1497 bp  418  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.98 
 
 		 1526 bp  416  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0595  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1508 bp  418  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0031  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1508 bp  418  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000247217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0330  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1508 bp  418  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00177691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0184  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1508 bp  418  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000878132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1508 bp  414  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1508 bp  414  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1508 bp  414  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1508 bp  414  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1508 bp  414  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1509 bp  414  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1509 bp  414  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  83.69 
 
 		 1509 bp  414  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>