More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0032 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_r00001  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1542 bp  854    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.01898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00006  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1542 bp  854    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0446208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00010  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1542 bp  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00367496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00011  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1542 bp  854    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0360816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00014  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1542 bp  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0514001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00017  16S ribosomal RNA  84.95 
 
 		 1542 bp  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0241491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00020  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1542 bp  854    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0003  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1530 bp  862    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000874227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0027  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1530 bp  862    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0078  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1530 bp  870    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0090  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1530 bp  854    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000103004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0098  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1530 bp  854    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000143523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0103  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1530 bp  854    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00308735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0113  16S ribosomal RNA  84.7 
 
 		 1530 bp  854    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000562425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  93.89 
 
 		 1548 bp  2284    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  93.89 
 
 		 1548 bp  2284    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1473 bp  1102    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  87.42 
 
 		 1473 bp  1102    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 1491 bp  973    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 1491 bp  973    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  91.96 
 
 		 1471 bp  1205    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  91.72 
 
 		 1471 bp  1735    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  94.21 
 
 		 1548 bp  2194    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  93.47 
 
 		 1548 bp  2101    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0001  16S ribosomal RNA  86 
 
 		 1519 bp  1104    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0020  16S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 1504 bp  1067    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0056  16S ribosomal RNA  85.67 
 
 		 1489 bp  1045    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0079  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1501 bp  1061    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 1477 bp  890    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 1477 bp  890    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 1477 bp  890    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  86.41 
 
 		 1477 bp  890    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 1555 bp  1001    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1542 bp  1269    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  90.27 
 
 		 1542 bp  1269    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0013  16S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 1495 bp  952    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000161102  normal  0.413867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0043  16S ribosomal RNA  85.92 
 
 		 1534 bp  952    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000126976  normal  0.0100443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0001  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1535 bp  868    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000556781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0007  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1535 bp  868    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000706702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0107  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1535 bp  868    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0127  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1535 bp  868    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  85.97 
 
 		 1513 bp  987    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  86.7 
 
 		 1532 bp  1152    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  86.7 
 
 		 1532 bp  1152    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0013  16S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 1555 bp  1352    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000280692  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0051  16S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 1555 bp  1352    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1496 bp  973    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1497 bp  973    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  87.06 
 
 		 1497 bp  973    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0069  16S ribosomal RNA  84.91 
 
 		 1555 bp  856    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00426901  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0120  16S ribosomal RNA  84.91 
 
 		 1555 bp  856    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0520691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0143  16S ribosomal RNA  84.91 
 
 		 1555 bp  856    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.328707  normal  0.910288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1551 bp  3075    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1551 bp  3075    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1551 bp  3075    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1551 bp  3075    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0005  16S ribosomal RNA  85.2 
 
 		 1541 bp  1037    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0138974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0021  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1541 bp  1045    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.877724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0028  16S ribosomal RNA  85.27 
 
 		 1541 bp  1045    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0078  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1541 bp  1041    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0085  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1541 bp  1041    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 1538 bp  1134    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 1538 bp  1150    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0001  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000407555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0008  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000302643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0022  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000152089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0073  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0121  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0129  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000475348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0138  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000622632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0142  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000521528  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0001  16S ribosomal RNA  85.06 
 
 		 1555 bp  886    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000995354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0009  16S ribosomal RNA  85.06 
 
 		 1555 bp  886    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000407076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0115  16S ribosomal RNA  85.06 
 
 		 1555 bp  886    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0123  16S ribosomal RNA  85.06 
 
 		 1555 bp  886    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0112353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2076  16S ribosomal RNA  84.8 
 
 		 1535 bp  866    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2706  16S ribosomal RNA  84.8 
 
 		 1536 bp  866    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000399166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  93.43 
 
 		 1563 bp  2206    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  93.43 
 
 		 1563 bp  2206    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0006  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1532 bp  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00024387  hitchhiker  0.000899429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0011  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1532 bp  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000927448  normal  0.022116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0042  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1532 bp  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00864789  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0077  16S ribosomal RNA  84.31 
 
 		 1532 bp  890    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44822  hitchhiker  0.00000268653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0097  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1532 bp  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000952791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0100  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1532 bp  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000228355  hitchhiker  0.0000041645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0103  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1532 bp  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0217624  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0110  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1532 bp  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0019  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1537 bp  868    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000102694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0033  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0082  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000820075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0129  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1537 bp  860    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000152153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  87.51 
 
 		 1544 bp  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>