More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0378 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0831  16S ribosomal RNA  99.8 
 
 
1524 bp  2997    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0378  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1524 bp  3021    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  83.74 
 
 
1545 bp  842    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  83.67 
 
 
1545 bp  835    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R05  16S ribosomal RNA  83.62 
 
 
2528 bp  803    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr01  16S ribosomal RNA  95.01 
 
 
1528 bp  2409    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr04  16S ribosomal RNA  95.01 
 
 
1528 bp  2409    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 
1545 bp  850    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1807  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 
1579 bp  571  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000448863 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1566  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 
1579 bp  571  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1620  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 
1579 bp  571  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0929772 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1585  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 
1579 bp  571  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1801  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 
1579 bp  571  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000298169 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0449  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 
1579 bp  571  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.3791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1544 bp  557  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0054  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1544 bp  557  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00288313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0062  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1544 bp  557  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0071  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1544 bp  557  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00175837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0059  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1544 bp  557  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0163  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 
1549 bp  549  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0633257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 
1544 bp  549  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 
1544 bp  549  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 
1544 bp  549  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 
1544 bp  549  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0068  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 
1544 bp  549  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0030  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 
1544 bp  549  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000811926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0090  16S ribosomal RNA  84.45 
 
 
1544 bp  549  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0019  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 
1549 bp  549  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.163804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1708  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 
1549 bp  549  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1835  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 
1549 bp  549  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.364981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0065  16S ribosomal RNA  84.32 
 
 
1544 bp  541  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 
1510 bp  533  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0341  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 
1509 bp  533  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SD  16S ribosomal RNA  84.19 
 
 
1507 bp  533  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.532325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5738  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5741  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5744  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5747  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1509 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5750  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5753  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1509 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5756  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5759  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1509 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5762  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1509 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5765  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0443196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5768  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1508 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.642383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1562 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-10  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-3  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-5  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-6  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-7  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-9  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1509 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.375942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1555 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1509 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_11  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1503 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1503 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1503 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1510 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SJ  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SA  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SC  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SE  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SF  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SG  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1507 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SI  16S ribosomal RNA  84.06 
 
 
1506 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000329338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>