More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0007 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0063  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1510 bp  1029    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000584218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  87.38 
 
 		 1526 bp  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0032  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1541 bp  745    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0034  16S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 1692 bp  967    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.262743  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0035  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1510 bp  1029    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.96913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0029  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1532 bp  3029    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000263797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  85.88 
 
 		 1501 bp  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0022  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1568 bp  1057    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000353945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  89.93 
 
 		 1431 bp  874    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  89.93 
 
 		 1466 bp  874    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0007  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1532 bp  3037    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000153134  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0060  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1512 bp  1029    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000786294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  89.93 
 
 		 1431 bp  874    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0050  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1532 bp  3037    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000160019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  85.88 
 
 		 1501 bp  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  85.88 
 
 		 1501 bp  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  87.12 
 
 		 1525 bp  688    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0038  16S ribosomal RNA  87.62 
 
 		 1533 bp  1154    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000360031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0055  16S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 1533 bp  1162    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000356677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0003  16S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 1533 bp  1170    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  89.93 
 
 		 1466 bp  874    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0002  16S ribosomal RNA  87.8 
 
 		 1541 bp  745    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  92.18 
 
 		 1555 bp  672    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  85.43 
 
 		 1513 bp  763    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0055  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1532 bp  3029    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000155222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0007  16S ribosomal RNA  87.76 
 
 		 1692 bp  967    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1517 bp  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1518 bp  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1518 bp  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1522 bp  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  86.26 
 
 		 1517 bp  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 		 1521 bp  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1521 bp  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 		 1521 bp  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  87.2 
 
 		 1521 bp  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1612 bp  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1612 bp  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1612 bp  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1612 bp  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1612 bp  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1612 bp  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1612 bp  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 1612 bp  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0042  16S ribosomal RNA  87.56 
 
 		 1568 bp  1057    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000217444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 1546 bp  638  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 1546 bp  638  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 1546 bp  638  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 1546 bp  638  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1522 bp  636  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1522 bp  636  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 1522 bp  636  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 1546 bp  638  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  91.55 
 
 		 1546 bp  638  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0020  16S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 1508 bp  634  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822564  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0052  16S ribosomal RNA  82.52 
 
 		 1508 bp  634  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0065  16S ribosomal RNA  91.35 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  91.35 
 
 		 1546 bp  630  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  85.64 
 
 		 1509 bp  626  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1641 bp  618  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  84.37 
 
 		 1505 bp  613  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  90.95 
 
 		 1545 bp  615  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  84.37 
 
 		 1505 bp  613  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  90.95 
 
 		 1545 bp  615  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1641 bp  611  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1641 bp  611  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1639 bp  611  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1641 bp  611  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1641 bp  611  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1641 bp  611  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 1641 bp  611  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0008  16S ribosomal RNA  90.46 
 
 		 1530 bp  611  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0950518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0015  16S ribosomal RNA  90.46 
 
 		 1689 bp  611  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.015768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0020  16S ribosomal RNA  90.46 
 
 		 1502 bp  611  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0013  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1524 bp  601  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0026  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1524 bp  601  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0100  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1544 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0008  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1544 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000638019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0029  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1544 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000227714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1545 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1545 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1546 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1545 bp  599  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 1512 bp  595  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 1512 bp  595  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1505 bp  589  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  85.15 
 
 		 1505 bp  589  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0016  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1359 bp  585  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0176439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0071  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1523 bp  583  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0089  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1523 bp  583  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00770001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0086  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1523 bp  583  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0165125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>