253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1643 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_1643  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3259  ribose-5-phosphate isomerase B  89.89 
 
 
178 aa  332  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000325628  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  39.69 
 
 
149 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  39.69 
 
 
149 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  39.69 
 
 
149 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  39.69 
 
 
149 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  39.69 
 
 
149 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  40.77 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  40.77 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  40.77 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  35.62 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.26 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  39.39 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  39.39 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  39.39 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  39.39 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  39.39 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  39.39 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  39.39 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.74 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  40.46 
 
 
145 aa  85.1  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  34.84 
 
 
153 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.93 
 
 
147 aa  84.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  39.69 
 
 
148 aa  84.7  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.87 
 
 
149 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  41.22 
 
 
148 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  36.15 
 
 
157 aa  84.3  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.46 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1446  ribose 5-phosphate isomerase B  36.64 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.396381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  39.23 
 
 
152 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.93 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  37.31 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  37.04 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  34.78 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  37.59 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  35.88 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  37.88 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  39.69 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  39.69 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.17 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  37.88 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  35.29 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  37.88 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  40.15 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.92 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  38.93 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  36.09 
 
 
160 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.43 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  37.16 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.58 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1548  ribose 5-phosphate isomerase  32.47 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.672639  normal  0.270598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  37.69 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.43 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  38.46 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  37.4 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.36 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.23 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  36.43 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  37.4 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.18 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0932  ribose 5-phosphate isomerase B  35.77 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29800  ribose 5-phosphate isomerase  40.15 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  35.77 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.66 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  31.16 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  35.88 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  33.79 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.85 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0682  ribose 5-phosphate isomerase B  31.85 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  36.64 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  32.33 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  34.81 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  34.81 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  34.56 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  32.33 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  32.33 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  36.64 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28680  ribose 5-phosphate isomerase  35.07 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.033398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  31.29 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  32.35 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  40.21 
 
 
166 aa  72  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  33.85 
 
 
149 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1003  ribose 5-phosphate isomerase B  34.31 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  34.44 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.84 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  34.38 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.58 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  34.07 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  32.56 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1145  ribose 5-phosphate isomerase  31.58 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  34.59 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  35.88 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4221  ribose 5-phosphate isomerase  34.33 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  27.7 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.33 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  32.06 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>